水質鹼化(PH值太高)的問題
水質鹼化(PH值太高)的問題大部分的魚友是用陽離子交換劑（即水族館賣的軟水劑，化工行與RO專賣店的揚離子交換樹脂）來製造軟水，然後再逐漸調降PH值即可。許多人在調降PH值時有個共同經驗，即是剛調降下來的PH值，隔天又恢復到原本的酸鹼度。其中原因很複雜，有關化學的部分，我也解釋不清。但正確的調降方式，不論是用磷酸還是市售的降酸劑，都得長期緩慢的調降。比方說500L水的原水質PH為8.0，第一天加入20CC降酸劑調降到7.8，第二天又回到8.0，此時再添加20CC調降到7.8，第三天再加20CC調降一次，第四天PH回復時可能只有7.9，如此反覆添加降酸劑，魚缸PH值會逐漸降低至您想要的數值，或許需要連續調降一至二個月，看您想調到6.5還是6.0。當然PH值回升的幅度與水質硬度相關，如果是軟水調降效果會較佳，............. 使用純水調降，效果會更好，但仍非一蹴可及的。同時魚缸若是裸缸，調降速率或許較快，但相對不易穩定；若有底沙，調降較慢，但降下來的PH值較不會因換水或清洗濾材而有劇烈改變。
理論上施打CO2會促使水質降酸，但實際使用上，CO2含量與降酸之間，與水質碳酸鹽硬度有關係。如果您的魚缸有底沙，而底沙含有大量的碳酸鈣，CO2會溶解碳酸鈣，釋放出鈣質，反而會使水質硬度升高，造成降酸成果有限。
如果您是用PH值監控器的話，就會造成CO2大量耗損，PH值降低有限。如果裸缸的話，情況可能會好些。但一旦停止CO2供給，水質PH值又會回升，而且會因CO2含量不足，造成碳酸鈣沈澱，即所謂「脫鈣作用」。所以很多魚友都會建議先把水質變軟，再來考慮降酸問題。
軟水的方法，.....................使用RO逆滲透水（功能與蒸餾水或陰陽離子交換劑處裡的純水一樣）是不錯的方法，或者使用草泥丸（Peat），以其中的碳酸氫根離子（HCO3-），連接水中的鈣離子，並釋放出CO2。但草泥丸不能長期使用，因為經過生物分解後會釋放出無機鹽，反而會對軟水作用產生反效果。最常用的是鈉型弱酸性陽離子交換樹脂，1L可處理6000L軟水，可經再生重複使用，但一般經驗是陽離子交換樹脂軟水速率好像較慢。水質軟化後，再用CO2或降酸劑成效較佳。
水質酸化(PH值太低)的問題
建議.........在過濾盒上加一點白色珊瑚沙大顆的,一點一點慢慢加否則PH值會太高.
龍缸裡的PH值迅速降低，理由蠻複雜的。
...........是否嘗試過魚缸PH值降低的極限？如果最低仍能保持在6.2-6.5，應該可以不必刻意調高PH值。
一般魚缸水質PH降低，若是草缸主要是人為控制H+含量所致，比方用CO2來增加H+含量。但龍缸很少人會用CO2降酸，因此龍缸降酸通常可從兩部分解釋。
其一，...........原水質是否用RO過濾處理的水？或是換水時加入RO過濾處理的水？一般經過RO過濾的水質KH值較低，即碳酸氫根離子濃度較低，魚缸PH值緩衝作用較低，水質容易酸化。
其次，與過濾循環系統有關，魚缸的硝化作用穩定情形下，會導致降酸功能。理論上，硝化作用累積的硝酸鹽，雖未必都具降酸功能，但部分硝酸鹽如硝酸銨的銨離子（NH4+）與水（H2O）作用後會產生H+，這是造成降酸的主要原因。當然H+的多寡與水中的碳酸氫根離子（HCO3-）也有關係。換言之，在正常飼養情形下，水質酸化代表硝化作用正常，倒不必太擔心，可以採用換水的方式降低硝酸鹽含量。如果降酸速度較快，建議嘗試調高水質KH值，水中碳酸氫根離子濃度較高，有抑制PH值降低的功能。
方法...........建議水中加入珊瑚沙，利用碳酸鈣的碳酸根與水結合，產生OH-濃度增加，提高PH值。 其實從您的魚缸描述看，我覺得PH值倒不是嚴重問題，而您的過濾容積好像有些不足。................5尺缸在飼養少量魚隻的情形下，排泄物與殘餌也獲得良好的控制，產生的蛋白質與分解出來的氨並未過量，魚缸酸度下降，表示硝化作用正常。但也有可能是維持在平衡邊緣，因為............5尺缸僅配備六個滴流盒，過濾容積有限，硝化菌數量未必很多，能夠維持平衡，主要仍在於魚隻數少與殘餌控制。
需注意，一旦魚隻數量增加，或殘餌過多，超過目前過濾循環飽和分解量，水中將會存在大量有毒的氨，這個問題比PH降低更嚴重，尤其是裸缸對循環生態平衡更脆弱。建議增加高過濾面積的濾材，比方說把濾棉與生化棉合併在第一層，第二層放置生化球，第三層改置石英石或麥飯石，利用多孔隙濾材增加培菌效果。如果能有底沙，對水質穩定功效更大。儘管很多龍友不喜歡鋪底沙，一方面清理較累，長期未清理的話也很容易造成水質污染，另一方面龍魚容易因此受傷；但只要日常維護工作做好，我仍舊傾向於鋪設底沙。
大部分的氨都有效分解為亞硝酸並再分解為硝酸鹽，所以出現降酸的情形。尤其是缸裡還有超能吃超能拉的魟，也有效提供硝化菌執行工作的「能源」。所以當魚缸生態能大量「投入」可供硝化菌分解的物質，同時過濾容積也提供大量繁殖硝化菌的空間，其「產出」的硝酸鹽濃度應該很高，對水質中的碳酸氫根的消耗應該很大，造成PH緩衝降低，當水中碳酸氫根消耗殆盡，PH值會降低的可怕。
一些報告指出，KH＝1時，即碳酸氫根離子濃度僅10PPM，PH會低至4左右。所以..............建議.......要注意氨濃度過高的情形，應該不會存在，反而是要注意PH值嚴重降低。
換水是一般魚友建議的方法，可減低硝酸鹽濃度，同時也減緩碳酸氫根的消耗。除了換水之外，仍舊建議增置含碳酸鈣的物質，如珊瑚沙，讓碳酸鈣的碳酸根離子去結合氫根離子，一方面會增加碳酸氫根離子濃度，一方面會產生OH-，使水質變鹼。
硝化菌與光合成菌有何不同
光合硝化菌」一般拿到的光合菌種應該是
Pseudomonadales目、Rhodobacteriineae亞目、Rhodospirillales科底下的各種菌種。
說簡單點，就是那些看起來紫紅紫紅，聞起來臭臭的那些菌種。
這些菌種裡面，現在已經發現的，其將有機氮化合物轉化成銨根離子的能力應該還不錯，但是將其轉化成亞硝酸？ 我非常的懷疑。再從亞硝酸轉化成硝酸根離子？
就算可以，其活性也非常低。所以那些菌，只能稱之為「光合菌」，其目的在於去除於缸中大量堆積的「含碳有機物」，至於氮化合物，幾乎全部都留下來囉。
所以別買錯，光合菌是你魚缸混濁時、有機物太多時用的。要去除亞硝酸，要用「硝化菌」。不知道哪種？打開來看看！
第一，硝化菌不臭。硝化菌的菌液成澄清狀或有些許懸浮物。
第二、顏色應該是很淡很淡的粉紅色，或根本無色。(粉紅色是選擇性培養機中的 phenol red 染劑，濃度極低，對魚無害)
第三、請仔細看看它的生產日期！一般淡水的硝化菌，在常溫下出廠大概六個月就會幾乎沒有效用了。
第四、瓶子上應該要有 Nitrobacter, Nitrosomonas 這兩種菌種名稱出現(淡水用的) ，如果沒有，可能有問題。
重點是：要除有機物，請用光合菌。要除氮化合物(銨、亞硝酸離子等)，請用硝化菌。用錯徒然增加水族箱以及自己荷包的負擔。
ps此文章僅供閱讀，原作者保有一切的權利。
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發信人: fredii@Palmarama (感謝老天，再多給我一點) 看板: Aquarium
標 題: Re: 硝化菌v.s.光合菌
發信站: 台大計中椰林風情站 (Wed Aug 8 06:32:08 2001)
==> cycdennis ( ) 提到:
> 最近上bbs看了很多高手前輩的大作...但對硝化菌和光合菌的分別仍不太懂？
> 1.市面上大部分賣的是硝化菌還是光合菌？(好像只有azoo有賣光合菌)
> 2.粉狀的好還是液狀的好？....是否都有保存期限？需要'冰箱'保存嗎？
> 3.總的來說消化菌和光合菌，...哪種比較需要....？
1. 市面賣的，有顏色的是光合菌(紅色、深紅、粉紅、深橘紅....菌液濃稠)。沒顏色的是硝化菌。(無色、極淡粉紅色... 菌液澄清只有些許懸浮物)
2.
液狀的比較新鮮，粉狀的容易保存。液狀的大部分是純菌體和培養基，粉狀的是菌體倒在特定擔體粉末上噴乾的。用溶解後統體積來計算，液狀活菌體較多所以較貴，粉狀比較便宜。(大致上來說是這樣，但是如果廠商直接用菌體冷凍乾燥，那就會相反，因為這樣成本太高)
另外，確實有保存期限，但廠商也沒辦法確定是多久。三個月以上的我建議就盡量別買了，六個月....活菌量已經極低了，買了會當冤大頭的。(以上是液狀，粉狀的則可以保存較久一點，大概一年吧)
冰箱？... 當然是可以用來保存。但是是在菌體活性很高的時候就放進冰箱。也就是新鮮一點的才冰，不新鮮的算了。(用光就算)
還有，只能冷藏，不能冷凍。冰太久還是會降低效果很多的喔。
3.
總的來說？...看你的水族環境。效果上，光合菌預防重於治療，硝化菌相反。如果餌料加很多，餌的成分碳量較高，則光合菌派上用場的機會大。如果不太換水，缸裡水草又少，則兩者皆須。如果亞硝酸已經濃度太高，就只有硝化菌能救。
但是喔，兩者添加過量(一次加了幾十cc)，危險性都不小。請小心！！
主要是兩者在出廠時，必定添加些許培養基以維持菌體活性，不然到消費者買時，菌體都死了一大半，會使消費者認定其產品不良。但這些培養基，光合菌的會使菌體在環境中快速繁衍，所以魚缸可能會處於缺氧狀態；而硝化菌的培養基，會有些許的亞硝酸，雖然量低，但是加太多就會有危險性。
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前面有作者提到這種自己會長的東西，不用買。
我個人認為，買了安心、用的好用的話，就可以買。但是不買就得承擔一些風險，也要懂得一些緊急措施，也要常常監測。說穿了，跟投資者買共同基金是一樣的。風險較小，花的錢多，但是花的精神可以比較少....
舉個例子吧。光合菌是養殖業傳過來的。
養石斑養虱目的人，通常一個池子就好幾十萬到上百萬的預期收入。但是常常可以看到入行的新手，一夜之間整池死光，沒有原因或理由。
那買魚苗和餌料的十幾二十萬真的是丟到水裡面了，還連噗通一聲都沒有。
所以咧，常常可以看到一些養殖業的漁民，光合菌拿起來整桶整桶的倒進池子裡，好像不用錢的。(一大桶幾千塊咧...)
可是哩，光合菌可以抑制池中病菌的生長，因為光合菌長的快又壯。而且魚可以吃光合菌，光合菌在魚的腸道裡面還能同樣發揮抑制壞菌的效果。
(有點像優酪乳裡面的乳酸菌囉..) 更優的是，有研究報告顯示光合菌體的一些成分，可以是一些 carotienoid
(類胡蘿蔔素?)的前驅物，有助於魚體維生素的供應。
OK, 反正養殖業就是用光合菌來避風險以及促進魚體生長的。
養殖業用不用硝化菌？ 沒聽說過。
因為養殖業會大量抽水打水，加上亞硝酸的濃度變化不容易是一夕之間，所以因為亞硝酸毒性而導致大量死亡的情況並不常見。但是我推測還是有養殖業者是因為這因素而槓龜的。不過如果要添加硝化菌，成本可就比添加光合菌貴囉...
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硝化細菌的認識
不少魚友對硝化細菌的認識産生了一定的誤解，有的人認爲硝化細菌能夠分解糞便；有的認爲可以淨化水質，中和水中的懸浮物，這些認識是不準確的，或者可以說是錯誤的。那麽下面我就談談我對硝化細菌的認識，有不正確的地方希望大家給我指正出來。
1、首先先說說分解有機物，這個粗重的體力勞動可不是嬌貴的硝化細菌能完成的，他是靠其它淨水細菌完成的。在水生態循環係統中，若無其它異營性細菌存在，水中將到處充斥未被細菌分解的有機物，此種自我汙染的水族環境一樣使魚兒無法生存其中。因此，它們常被視爲是水質自淨作用的先鋒部隊，其重要性並不亞於硝化細菌。這類細菌普遍存在於各種不同環境，它們幾乎無所不在，而繁殖速度相當驚人，大部份的異營性淨水細菌，在理想的環境只需幾十秒鍾即可自行增殖一倍，一般只需二十幾分鍾即能增殖一倍。但要是裸缸飼養，我們就要借助物理循環，把水中的剩餌或糞便吸出。
2、關於淨化水質，中和水中懸浮物的問題。魚友中不少人去買硝化細菌，按照說明每星期按時添加，這樣做對嗎？回答是完全正確加100分。可我要告訴大家的是，你們的做法沒錯，可你們對硝化細菌的認識産生的錯誤。因爲我們買的這種每星期添加的所謂的硝化細菌其實是光合細菌。
光合細菌，俗稱：b菌。光合細菌是一種水中微生物，因具有光合色素，包括細菌葉綠素和類胡蘿蔔素等，而呈現淡粉紅色，光合細菌能在厭氧和光照的條件下，利用化合物中的氫並進行不産生氧的光合作用。
光合細菌可以在某種汙染環境下生存，並擔負著重要的淨化水質的角色。但只有在生存環境和汙染物質符合其生理、生態特性時，才會發揮其作用，否則很難獲得預期。例如在無光或者有氧環境下，光合細菌就很難發揮效果。
水族箱中若存在光合細菌，它將那些有機質或硫化氫等物質加以吸收利用，而使耗氧的異營性微生物因缺乏營養而轉爲弱勢，因而降低發生有毒分解産物的機會，同時，底質中的水質借以得到淨化，而促使養殖的水族生物的健康成長。
目前，水族市場出售的光合細菌，主要是光能異營型紅螺菌科（rhodospirilaceae），特別是其中的紅假單細胞屬（rhodopseudomonas）的種類。這種光合細菌在不同的環境條件下，能以不同的代謝方式，有效地淨化水質。需要注意：光合細菌在水質ph8.2-8.6的環境下發揮效果最佳，因而比較適合在海水水族箱中使用。所以這中光合細菌只能起到短暫的效果，因爲我們魚缸裏沒有他生活的理想環境。除非我們制作一個無氧過濾區還要有照明。
現在步入正題，談談大家即熟悉又陌生的硝化細菌
1、說到硝化細菌，我們又要老生常談了，想要了解硝化細菌就要首先明白什麽叫氮循環，那麽我下面花個草圖，希望對大家有所幫助
第一步：
魚類的排泄物和未吃過的食物將會轉變爲氨（俗稱阿摩尼亞）；那是因爲在這些東西裏需要氧的細菌會令蛋白質分裂。而氨是有毒的。
第二步：
生存於氧氣中的硝化細菌，能把氨會轉變爲亞硝酸鹽（NO2）；亞硝酸鹽雖然含較少的毒素，但仍對魚類有致命的毒害。
第三步：
亞硝酸鹽及後又被第二種硝化細菌轉變爲硝酸鹽（NO3）；而這硝酸鹽幾乎是無毒的，但突然或長期暴露在高濃度的硝酸鹽裏是有害的。但幸運地，硝酸鹽的濃度是可以靠更換魚缸的水來降低。
第四步：
硝酸鹽及後會被不依附氧氣而生存的細菌（厭氧性細菌）變爲氮氣而升華，這就是一個完整的「氮化合物循環」。
2、麽叫做硝化細菌
硝化細菌 ，俗稱A菌( nitrifying ) 是一種好氣性細菌，能在有氧的水中或砂層中生長，並在氮循環水質淨化過程中扮演著很重要的角色。它們包括形態互異類型的一種杆菌、球菌或螺旋菌。屬於自營性細菌的一類，包括兩種完全不同代謝群：亞硝酸菌屬 ( nitrosomonas ) 及硝酸菌屬 ( nitrobacter )。
亞硝酸菌屬細菌一般被稱爲「铵之氧化者」，因其所維生的唯一食物來源是铵，铵和氧化合所生成的化學能足以使其生存。什麽是铵？這須要解釋一下。其實铵是一種氨氣 ( nh3 ) 溶於水中所生成的陽離子 ( nh4+ )，因爲它在化學上的行爲就好象是一種金屬離子，故命名爲「铵」。氣體的氨具有刺鼻的臭味，而離子態的铵則無特別的氣味，故很容易加以辨認。
在有空氣存在時，铵可被亞硝酸菌屬細菌吸收利用。它們將其氫原子氧化成水，用氧取代之，所以铵變成水及溶於水中的氧化氮，後者化學家稱爲「亞硝酸」，其反應式如下：
藉由氧將铵氧化爲亞硝酸 ( no2- ) 可以産生能量，亞硝酸菌可利用該能量從二氧化碳或堿度 ( 如 co32- 或 hco3- ) 中制造有機物，所以這類細菌根本不需要有機物就能生存及繁衍。
硝酸菌屬細菌一般被稱爲「亞硝酸之氧化者」，因其所維生的主要食物來源是亞硝酸，亞硝酸和氧化合所生成的化學能足以使其生存，而且生成硝酸爲氮循環的終産物，其反應式如下：
硝酸菌可利用此反應所産生之能量，用於合成自己所需之有機物，故這類細菌同樣不需要攝取有機物也能生存及增殖。
铵被硝化細菌氧化成亞硝酸，隨後又被氧化成硝酸的反應被化學家稱爲「硝化反應」。這個反應係由兩種不同的細菌所進行的，須密切配合，才不致使反應的中間物 no2- 滯留累積於水中。
3、如何提高足量的硝化細菌？
在養殖池中存在的有毒物質主要是氨及亞硝酸，這兩種有毒的物質可由硝化細菌所消耗，並生成無毒性的硝酸，硝酸又是藻類的最佳氮肥，能被藻類所吸收及同化。因此，在養殖池中絕對不可缺少硝化細菌，如果硝化細菌缺乏，水中的氨含量將急速增加，使池水內的魚蝦有致死的危險。許多人通常不了解這個問題的重要性，以致於常遭遇到養殖失敗的命運。這說明如果您不去了解這個問題的症結所在，並謀求改善的話，既使是有經驗的業者，都可能會敗在硝化細菌不足的危害之下。
從池水的生態觀點來說，我們是無法防止氨的産生的，但是卻可以設法提高硝化細菌的數量來消耗池水中大量的氨。因爲硝化細菌是消耗氨的克星，只要這類細菌的數量足夠，它們就會很自然地消耗掉每天自産的氨，使氨不會在水中被大量的累積下來，成爲水産養殖的隱形殺手。
至於我們應如何做才能提高硝化細菌的數量呢？從理論的角度而論，爲硝化細菌塑造一個理想的繁殖場所是最根本的解決辦法。怎麽說呢？原來硝化細菌在繁衍過程中，有附著於固定物外表的傾向，若能在池水中安置若幹多表面積的固定物供其附著，它就能迅速地附著在這些固定物的表面上，並開始增殖。
然而，要在池水中安置固定物通常是不可行的，理由是這種方式可能會阻礙魚類的活動及不利於撈補。比較可行的處理方式是在過濾係統中安置「生化培養球」，這種産品是專門爲硝化細菌提供一個繁衍場所而設計的，它通常是由黑色的塑料骨架所制成，大小約爲 3 ~ 5 公分直徑的空心球體，並有很大的表面積可供硝化細菌附著。它的原理是讓硝化細菌成爲「有殼蝸牛」，增加硝化細菌的生活空間，因此可讓硝化細菌依附在這種人造的球體上進行硝化活動，使濾水中的氨及亞硝酸被硝化細菌所消耗。
添加硝化細菌制劑也是另一種可行的方法，尤其是在做水質檢測發現水中氨濃度偏高時，采用這種方法最有效率。但這種方法只是治標方法，不是治本方法，因爲這些制劑在水中被活化成爲活菌之後，它們仍然多屬「無殼蝸牛」，在池水中無法增殖，甚至因環境不適而逐漸死亡，故必須定期添加才能發揮預期效果。
4、如何正確使用生化培養球？
生化培養球又稱爲生化過濾球，它是一種藉由生物化學的方法來除掉氨的一種特殊濾材，不過它並不是依靠濾材本身的作用將氨除去，而是藉由生活於濾材表面的硝化細菌來將氨給氧化掉，使之轉化爲無毒性的硝酸，以減少有毒物質的堆積，爲養殖生物創造一個優良的生長環境。
生化培養球具有廣大的表面積，且交錯網孔構造可在表面達到完全通氣效果，更由於生化培養球若彼此互相接獲連接在一起，可在過濾係統中形成一個巨大的活動空間讓硝化細菌居住及生活，並有利於硝化細菌大量的繁衍。
這種産品在使用時，最好與機械式過濾係統結合成一體，不宜單獨使用，即可在機械式過濾係統的濾程後面，加設一個「生化培養球箱」，內置生化培養球，僅讓濾水由上自動滴流而下，然後再經由滴流過程中的硝化作用，來達到最完美的生物自淨作用。
如果將生化培養球單獨使用，可能無法達到預期的效果，因爲若直接把池水引入「生化培養球箱」，水中難免會夾帶不少有機廢物，由於它們不受硝化細菌所歡迎，若讓這些有機廢物附著於生化培養球上，則硝化細菌就很難在其表面著床生長。因此應將池水中的有機雜質先行濾除之後，再將濾水引入箱中，才是正確的使用方法。
5、硝化細菌制劑的使用
硝化細菌制劑是一種用於控制養殖池水自生氨濃度的處理劑，不僅使用相當方便，而且能發揮立竿見影的效果，故越來越受漁友的歡迎。使用時可直接將該劑散布於池中，不久即能發揮除铵的功效。
市售硝化細菌制劑可分爲活菌及休眠菌兩種，漁友可依自己的需要選購使用。前者是利用細菌的活體制成，在顯微鏡的觀察下，可看到它們的活動情形。後者是利用休眠菌制成，在顯微鏡的觀察中，則無法看到它們具有活動能力。
選擇活菌的好處是除铵效果迅速，最適用於氨濃度過高的緊急情況。但是因活菌對氧氣的要求十分嚴格，尤其是硝酸菌屬的細菌只能在有充份氧氣存在下才能生存，正因爲如此，要將活菌保存並制成産品，常有保存上的困難，所以在購買這類産品時，要特別注意它的有效使用期限，如果使用過期産品，就除铵的觀點而言，也是沒有什麽效率的。
擇休眠菌的優點是能耐久藏，較不用擔心失效的問題，但是因爲由休眠菌變成活菌所需的活化時間可能需要數天之久，所以無法使用於緊急狀況之處理，僅適用於日常的水質管理。一般言之，休眠菌的保存期限約爲 1 ~ 2 年，使用時仍需注意商品所標明的使用期限，以免過期失效。另外，此種産品僅亞硝酸菌屬之細菌能被制成制劑，故使用後可能會有多余的中間物 no2- 滯留累積於水中，使亞硝酸的濃度有暫時性突然提高的現象，惟對水質不會有明顯之影響
6、硝化細菌的注意事項
水中有有機汙染源,淨水細菌是靠水中有機汙染而存活的，如果因爲水中沒有汙染源存在，它們就無法長期生存。因此，在新水階段就加入細菌是否有效，是值得研討的。
勿與消毒殺菌藥劑同時使用
爲了避免淨水細菌被殺滅，切記勿與消毒殺菌藥劑同時使用，如果必須使用殺菌藥劑或治療魚病的藥劑，需等藥物使用至少一星期以上再進行使用淨水細菌。
要注意調整適合細菌生長的溫度
在淨水細菌的使用過程中，能有效地控制在最適宜的水溫條件下，當然其發揮的效果也是最理想的。例如：光合細菌在23-29℃的範圍內均能正常生長繁殖，當水溫低於23℃時，它們的生長逐漸停滯，因此低於23℃的水族箱使用這類細菌效果較差。
要注意調整適合細菌生長的ph值
在淨水細菌的使用過程中，必須注意水質酸堿度ph的變化。例如：淡水硝化細菌在ph值等於中性時的效果最佳，在酸性水質中效果最差，因此若能將水族箱中的水質調整至中性或弱堿性，它的淨水效果會好一些。而光合細菌在ph值8.2-8.6的水質中最具效果，所以它比較適合用於海水水族箱中的使用。
要注意細菌之間的共容性
若要同時放養不同的淨水細菌應該注意細菌之間的共容性。例如：硝化細菌和光合細菌並不適合同時放養在同一水族箱內，因爲它們淨化水質的過程互有抑制作用，可能會降低其淨化效果。
要爲細菌提供足夠的可居住空間
如果只讓細菌生活於水族箱中可能無法滿足其繁衍上的需要，這會嚴重限止細菌的數量使其無法增加。因此，我們應該配合生化過濾係統爲細菌細菌再創造更多的可居住空間供它們繁衍，以期待它們加速降低有害物質以及加強它們分解能力。
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